宏基因組學(Metagenomics),又稱元基因組學,是以特定環境樣品中整個微生物群落基因組作為研究對象,無需分離培養,直接提取環境樣本的DNA進行高通量測序,對環境中微生物的群落結構、菌群多樣性、物種分類、功能活性、相互間的協作關系以及與環境之間的關系等宏觀特性進行研究,分析環境微生物群體基因組成及功能,解讀微生物群體的多樣性與豐度,探求微生物與環境、微生物與宿主之間的關系,可以更準確地反應出微生物的真實生存狀態。
宏基因組測序不依賴于微生物的分離培養,克服了傳統的純培養方法的技術限制,擴展了微生物資源的利用空間,為微生物研究提供了有效工具。目前,已廣泛應用于環境和微生物研究領域。
泓迅科技的宏基因組測序服務可以針對土壤、空氣、水體、淤泥、腸道菌群等任何來源提取的全基因組DNA進行檢測,除了已純化的基因組DNA,也可以提供土壤、糞便、液體和組織等樣品。
服務優勢
高通量覆蓋可全面檢測生態環境中的微生物信息,單次測序針對樣本中所有物種,充分挖掘環境樣品中的微生物菌群和功能基因,最短可在20個工作日交付檢測報告。
宏基因組測序采用先進的HiSeq 4000測序平臺,快速、高效地讀取高質量的測序數據,讀長更長。
可檢測單個堿基差異,準確性高,質量可靠;對于高低豐度的物種基因都能夠發現。
提供多套引物及科學的實驗方案設計,能檢測真核生物DNA含量較高的樣品,解決各類檢測需求;提供全面的抗生素因子分析,可根據客戶需求提供定制化分析服務。
技術路線

服務詳情
服務項目 | 樣品類型 | 測序平臺 | 送樣要求 |
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宏基因組測序 | 宏基因組樣品 | HiSeq 4000, PE150 | 環境樣本:土壤:5-10g;糞便:3-5g ;沉積物:5-10g;液體:25mL。 水體:選0.22μm或0.45μm的濾膜,過濾,水樣體積5-10mL,最適濾膜面積3-4cm。DNA:總量 ≥ 1 μg、濃度 ≥ 10 ng/μL、1.8 < OD260/280 < 2.0 |
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